據了解，托管后將由灃渭新區黨工委和灃渭新區紀檢委全面負責灃渭新區黨的工作和紀律檢查工作。灃渭新區黨工委（紀工委）在托管街道設立派出機構，開展相關工作。設立灃渭新區工會、共青團、婦聯組織，負責轄區內工會、共青團和婦聯工作。行政管理體制實行管委會-鄉鎮街辦兩級行政管理體制。西安灃渭新區管理委員會代表市政府對轄區實施行政管理，管委會通過設立內部機構、派出機構，協調、領導市級行政管理部門在區域內設立的分支機構和托管街道辦事處等機構，全面管理轄區經濟和社會事務。
這些機構的確立，令灃渭新區在結構上更趨向于政府而非開發區。但灃渭新區方面表示，將加強創新機構設置，實現管理精簡高效，按照“大部制”和管委會-街辦兩級管理模式，推行“小機構、大服務，小政府、大社會”管理；整合資源，提高工作效率。
新的管理體制能給開發建設帶來便利，但在托管之后，如何協調“開發區模式”與“行政區模式”之間的關系，“開發區模式”的高效率能否延伸到托管地區，都是擺在灃渭新區面前的考驗。另外，新的管理模式是否會帶來開發模式的轉變？灃渭新區會否走上一條像上海浦東新區、天津濱海新區一樣，從城市新區轉向真正行政區的道路？這都是社會各界討論和關注的焦點。
專家觀點
地位特殊 可嘗試行使更多的社會職能
西安灃渭新區管理委員會為西安市政府派出機構，受省西咸新區建設領導小組和西安市政府雙重領導，管理體制和運行機制采取“開發區模式”。
西安人對于“開發區模式”并不陌生，此前成立的“四區一港兩基地”對西安的產業及經濟發展發揮了強力的帶動作用。
但灃渭新區的定位是意義更為廣泛的“城市新區”，注重城市功能、配套設施的提升，營造人們生活和產業所需的和諧與便利。
陜西省社科院學術委員會副主任張寶通表示，傳統的開發區管委會是經濟事務機構，并不承擔或只承擔一小部分社會事務職能，在處理一些區內事務時會受到其他方面的制約，甚至有些部門出現“扯皮”現象。對灃渭新區而言，這樣的模式并不能滿足其開發建設的效率需要。
張寶通說，西咸一體化是實施關天經濟區戰略的關鍵一環，而灃渭新區處于西咸交匯處，是西咸新區的核心區域。灃渭新區能否建設得順利、成功，將對關天經濟區的構建產生極為重要的影響。特殊的地位決定了其特殊的管理模式，托管方式將使灃渭新區嘗試行使更多的社會職能，便于統一開發建設和管理，保持托管街道發展和干部群眾利益的整體平衡。
人事制度
運作靈活 有能力的年輕人會成為主力
由于開發區和行政區人事制度的差異，托管地區人員的身份成了社會普遍關注的問題。行政區的工作人員以公務員和事業單位編制為主，而開發區一般采用聘用制，除了部分高層由市政府派出外，其他人員均面向社會招聘，管理、考核上更像企業，末位淘汰、換崗的情況并不少見。此次托管有近3000名在編人員的人事關系轉到了灃渭新區。
這次托管有一條重要的原則是人隨事走，身份不變。按照《灃渭新區鄉鎮街道托管及有關管理體制方案》，灃渭新區的人事干部管理體制為：黨工委、管委會的工作人員按照開發區體制管理；街道辦事處人員的任（聘）用、待遇、考核由灃渭新區黨工委、管委會統一組織實施，對各類財政供養人員，保持托管前的身份不變，待遇適當提高。