在分組審議食品安全法修訂草案時，一些常委委員和列席人員建議，進一步完善食品安全事故調查程序。
草案規定：調查食品安全事故，應當堅持實事求是、尊重科學的原則，及時、準確查清事故性質和原因，認定事故責任，提出整改措施。調查食品安全事故，除了查明事故單位的責任，還應當查明負有監督管理和認證職責的監督管理部門、認證機構的工作人員失職、瀆職情況。
全國人大華僑委員會委員李昭玲建議在上述規定中，進一步明確查處食品安全案件的指導性原則，比如：按照什么原則收集證據，怎樣調查事故原因，如何判定事故責任等。
李昭玲說，在食品安全事故調查中，事故因果關系的認定是查清事故原因、確定事故責任的關鍵。但實踐中存在一種情況：在發生“扁豆中毒”的情況下，難以依據現有的食品安全標準來查明事故原因，也就難以確定食品安全事故責任。因此，建議在現有規定的基礎上，進一步明確辦案指導原則指引事故調查活動，以彌補在適用標準時技術手段的不足。
王毅委員說，草案關于食品安全事故調查一章沒有突出事故處理的關鍵環節，建議修改時突出三個方面：明確工作原則和程序；明確組織責任和分工；建立協調機制。
董中原委員說，草案規定，有關單位和個人應當配合食品安全事故調查處理工作，按照要求提供相關資料和樣品，不得拒絕。任何單位和個人不得阻撓、干擾食品安全事故的調查處理。但對于拒絕、阻撓和干涉的法律后果沒有規定。為了加強法律的威懾力與執行力，建議在法律責任一章中增加拒絕提供相關資料和樣品、阻撓和干涉食品安全調查的法律后果的條款。記者陳麗平