3天后，北方軍隊就占領了韓國首都漢城(今首爾)，釋放了漢城監獄中的囚犯，其中有數千人加入了北方軍隊。消息傳來，潰退中的韓國政府更加驚惶。由于擔心左翼政治力量加入敵方陣營，韓國政府決定 “國家教導團”(韓國政府之前成立的對左翼人士進行教育和管理的專門機構)控制的左翼人士由警察系統來看管，并開始準備大肆屠殺。
美國國家檔案館一份長達78頁的材料記錄了當時美軍顧問艾默里奇中校從韓國的金鐘元上校處了解到的情況， 金鐘元被告知一旦北方軍隊到達釜山外圍，他就可以打開監獄大門，用機槍對犯人進行掃射。這是這批解密檔案中發現的第一份美軍認可此類屠殺行為的文件。
于是，大規模的屠殺，開始了。
鏡頭中的人間地獄
漢城南部90英里處的山谷是個狹窄而安靜的地方。然而，1950年7月的幾天里，鮮血和槍聲是這片寧靜之地的主旋律。成卡車的共產黨員被從大田監獄運到這里，走向生命的終點。一些美軍軍官前往觀看了被稱之為“宰火雞”的血腥場面，并拍下了許多駭人的屠殺鏡頭。
在山谷里，被反綁雙手身穿白衣的犯人們，順從地彎著腰，面向土溝擠在一起。韓國軍警走到囚犯們身后，朝他們腦后開槍，尸體就勢滾入溝中。一位現年83歲的李姓警察參加了當年的行刑，至今仍對扣動扳機“心懷罪感”。他回憶說：“許多犯人是普通罪犯，還有被誘捕來的不識字的農民，他們本不該死，他們對共產主義一無所知。”現場的警察們有的從未殺過人，拿槍的手發抖，以致沒有射中要害，有些犯人只是受了傷。但警察們最后受命不留活口，還活著的犯人遭到再次槍殺。
在這里被殺害的犯人多達3000-7000人，尸體疊著尸體，堆滿了六條溝，延伸至1英里外。填滿死者的大坑很快被掩埋了。在以后的歲月里，這些大坑連同半島上其它屠殺現場一起進入歷史的深坑，被人“遺忘”了。
在美國非官方文件中也有其他屠殺場景的描述。曾任美國空軍情報官員的唐納德·尼克爾斯在1981年自行出版的一本論文集中隱晦地提到，他目睹了漢城南部20英里處水原地區約1800名韓國犯人被屠殺的事件。
1950年8月2日，一份獲取自北方軍隊的文件與唐納德·尼克爾斯的記錄相互印證。這份已被華盛頓解密的文件述及了在韓國12座城市發生的大屠殺，水原有1000人被殺，大田有4000人被殺。這份早期的朝鮮北方的文件沒有提及當時在邊境地區仍在進行的屠殺，如單在釜山就有1萬多人被殺——這是一位名為Chan hyun的韓國立法人員在1960年經調查得出的結論。在李承晚下臺后，樸正熙軍政府執政前的短短的12個月的民主政府執政期間，他完成了這一調查工作。
據“真相與和解委員會”的歷史學家估算，大約有10萬人被害。這一數字是基于釜山的一個非政府組織的推斷做出的，相比當時韓國2000萬的人口總數，這一比例相當驚人。僅在慶尚南道就有25000人被殺，“國家教導團”中的3萬人大多數也被殺害了。
一位名叫Koh Chung-ryol的57歲的韓國婦女說，她時年29歲的父親在警方大規模的抓捕中被錯抓，之后在Sannae山谷被殺。她說：“父親被殺后，我母親毀掉了父親的所有照片，怕家庭被貼上通共的標簽。母親試圖抹掉關于父親的一切回憶，這種悲痛真是難以言表……”五十余年過去了，很多家庭仍不堪回首那段喪親之痛。
旁觀的美國人
大屠殺的消息被媒體報道后，美國人在一系列屠殺事件中的立場成為人們追問的焦點。在目前解密的檔案中，美國可以用“態度曖昧”來形容。如此重視“民主”和“人權”的美國政府緣何采取旁觀立場呢？這要從美國長期的反共產主義政策說起。