因為阿里地區人民醫院各種人才都很匱乏，血站當時也剛剛建立，而王干慧在商洛剛畢業的時候就在輸血科工作，后來才到生化室，有著豐富的輸血科工作經驗，就響應阿里地區人民醫院領導的指示，著手籌建輸血科。
他按照二甲醫院輸血科的評審要求，制定輸血管理文件，制定輸血反應處理規范和應急用血預案，開展血液質量管理的方案，建立有輸血過程的質量管理監控，落實輸血相容性檢測的管理制度，建立輸血不良反應預案，開展抗人球蛋白實驗新項目，并且給全院醫務人員進行關于臨床輸血內容的業務講座。
在這段緊鑼密鼓的創“二甲”日子里，王干慧完全把自己融入到了所經手的工作里。在檢驗科，他依然值二線班，有人發現的有異常值的不敢報的審查報告，他嚴格審核報告，并耐心給發現者講解原理。在輸血科，他擔任負責人，白天黑夜隨叫隨到，先后4次為搶救危重患者深夜進行交叉配血。
王干慧說，這期間比較突出的問題是阿里地區人民醫院沒有自來水，所以只能上班時間一直戴手套。盡管如此，還是被醫院經常無償為危重病人獻血的藏族醫生和家屬所感動。他在自己后來的工作總結里這么寫道：“自從踏上阿里這片土地，就深深地愛上了這片神奇而美麗的雪域高原，這里不僅山好水好，還有那么多純潔樸實、和藹可親的藏族同胞。在這里，遠離了故土，我卻依然感受到了家的溫暖。”
王干慧回到商洛之后，阿里地區人民醫院的輸血科交給了銅川去的一位援藏醫生。因為這名醫生沒有臨床經驗，遇到各種標本不清、標本凝塊等問題，依然微信請王干慧解答。
通過陜西省兩批“組團式”援藏醫療隊幫扶指導，阿里地區人民醫院在綜合管理、業務發展、醫療服務能力提升、內涵建設等方面有了很大提高。今年8月18日，阿里地區人民醫院通過了自治區衛生計生委專家組的評估驗收，正式成為二級甲等醫院。
家的溫暖
王干慧的談話中，一直在重復提及藏族同胞淳樸的天性，說他們如何單純善良，不爭名奪利。有一次他去一位退休的行署副專員家里做客，卻發現相對昂貴的只有電視、冰箱、電腦和藏式家具。而這種從上到下都不攀比的好的氛圍，普遍與信仰佛教相關。幾乎每家都有一個僧人，而家庭的收入90%捐贈給寺廟，剩下的10%也大部分花在吃飯上。他們不吃魚和豬肉，勤勞的人會花大量時間自制酥油茶和藏粑，懶散的就直接吃牦牛肉和羊肉。藏民基本安居樂業，對援藏干部心存感激。他們聽得懂漢語，路遇漢人會主動站起來微笑并遞上自己的茶。
首批“組團式”援藏隊伍到達阿里之后，阿里地區人民醫院的門診量和手術量提高了50%，婦產科再無死亡率。而抵藏的第一天，以咸陽一位顱外專家為首的5名醫生就成功完成了阿里死亡率較高的開顱手術。阿里地區人民醫院的院長和書記都非常感激，經常自掏腰包，請王干慧等援藏醫生去家里做客，增加豬肉菜肴，取出幾十年珍藏的好酒。藏族患者在化驗的時候遇到疑難問題，也經常主動打電話找王干慧請教。
王干慧的家人遠在商洛，但藏民們和他打成了一片，成了他的另一撥“家人”。好幾次王干慧路遇藏民玩耍，藏民主動將阿里隨處可見、內地卻極為稀有的石頭當禮物送給王干慧。王干慧也寧愿被高原上的太陽曬出幾個月都消不掉的比燒傷還嚴重的泡，也要跟隨醫療隊去下鄉義診，和藏民載歌載舞去孤兒院捐款。
王干慧說：“藏民守邊疆、天性淳樸，不知為什么，看到他們就想奉獻。”