6、移民科
負責擬定移民扶貧的有關政策和管理辦法；編制移民搬遷規劃和年度實施計劃；負責移民計劃管理；負責市內移民小區、移民新村的規劃與建設；負責市外移民的聯絡及跟蹤管理服務工作；組織實施移民搬遷工作；檢查移民優惠政策的貫徹落實，監督檢查移民補助資金的使用與管理。
7、資金計劃科
負責編制扶貧開發資金計劃，擬定資金計劃分配方案；擬定全市信貸扶貧政策、規定和資金管理辦法；負責市扶貧聯社日常工作和小額信貸運作管理工作，指導縣區扶貧社工作；負責農副產品加工以及扶貧實體項目的考察、審核、立項批復和組織實施工作；負責專項貸款貼息的管理工作；督促資金投入，考核資金到位情況，組織開展執法檢查；負責扶貧開發項目庫的建設和管理工作。
8、世行外資項目辦公室
負責扶貧開發、農業綜合開發的外資項目管理。具體組織實施秦巴世行扶貧貸款項目及其后續管理工作。
9、扶貧開發培訓中心
負責基層扶貧干部培訓、扶貧開發工作重點村農民實用技術培訓、貧困戶子女勞務技能培訓等工作。